"Esto nos ha llevado a suponer que se trata de un patógeno emergente que debemos vigilar"
La identificación fiable de los gérmenes cultivados es esencial en bacteriología clínica.
Sylvia Suter, University Hospital Basel
Los gérmenes desconocidos son habituales en los hospitales. Los investigadores de la Universidad de Basilea llevan muchos años recogiéndolos y analizándolos. Han identificado muchas especies nuevas de bacterias, algunas de las cuales son importantes para la práctica clínica.
Las infecciones bacterianas pueden tratarse con mayor eficacia si se conoce la causa de la enfermedad. En la mayoría de los casos, todo lo que se necesita para identificar un patógeno es un análisis en un laboratorio médico. A veces, sin embargo, los métodos habituales son insuficientes, por ejemplo, si la especie de bacteria aún no se ha clasificado o es especialmente difícil de cultivar.
Un equipo de la Universidad de Basilea y del Hospital Universitario de Basilea lleva desde 2014 recogiendo y analizando muestras de pacientes que contienen este tipo de gérmenes desconocidos. Los investigadores han descubierto más de treinta nuevas especies de bacterias, algunas de las cuales están asociadas a infecciones clínicamente relevantes.
Análisis genético completo
En total, el equipo dirigido por el microbiólogo Dr. Daniel Goldenberger analizó 61 patógenos bacterianos desconocidos encontrados en muestras de sangre o tejido de pacientes con una amplia gama de afecciones médicas. Los métodos convencionales de laboratorio, como la espectroscopia de masas o la secuenciación de una pequeña parte del genoma bacteriano, no habían dado resultados en todos estos aislados. Por ello, los investigadores secuenciaron el material genético completo de las bacterias utilizando un método disponible desde hace pocos años. A continuación, compararon las secuencias genómicas identificadas con cepas conocidas en una herramienta en línea.
De las 61 bacterias analizadas, 35 eran desconocidas hasta entonces. Los investigadores clasificaron las 26 cepas restantes como difíciles de identificar: o bien sus secuencias genómicas se habían añadido recientemente a las bases de datos, o bien hacía muy poco tiempo que se había creado una descripción taxonómica correcta de los patógenos. Una evaluación de los datos de los pacientes mostró que siete de las 35 nuevas cepas eran clínicamente relevantes, lo que significa que pueden causar infecciones bacterianas en humanos. "Rara vez se han publicado en el pasado vínculos tan directos entre especies de bacterias recién identificadas y su relevancia clínica", afirmó el Dr. Goldenberger.
Causa de infecciones raras
La mayoría de las especies recién identificadas pertenecen a los géneros Corynebacterium y Schaalia , ambos bacilos grampositivos. "Muchas especies de estos dos géneros se encuentran en el microbioma natural de la piel humana y la mucosa. Por eso se subestiman con frecuencia y la investigación sobre ellos es escasa", explica el Dr. Goldenberger. Sin embargo, pueden causar infecciones cuando entran en el torrente sanguíneo, debido a un tumor, por ejemplo.
Uno de los patógenos difíciles de identificar también podría ser clínicamente relevante. Se encontró en el pulgar inflamado de un paciente tras la mordedura de un perro. Un grupo de investigación canadiense también aisló recientemente esta bacteria de heridas causadas por mordeduras de perro o gato. "Esto nos ha llevado a suponer que se trata de un patógeno emergente que debemos vigilar", afirma el Dr. Goldenberger. En 2022, los investigadores canadienses dieron a la bacteria el nombre apropiado de Vandammella animalimorsus (Vandammella de mordedura animal).
Poner nombre a su nueva especie es el siguiente punto en la lista de tareas pendientes del equipo de Basilea. Colaboran estrechamente con el profesor Peter Vandamme, de la Universidad de Gante, especialista en clasificación de bacterias. Ya se ha dado nombre a dos de las bacterias. Una es Pseudoclavibacter triregionum, en referencia a la ubicación de Basilea, cerca de las fronteras de Suiza, Francia y Alemania.
Sin embargo, el proyecto iniciado por el equipo de Daniel Goldenberger dista mucho de haber concluido. Los investigadores siguen recogiendo y secuenciando sistemáticamente patógenos desconocidos hallados en muestras de pacientes del Hospital Universitario de Basilea; ya se han detectado más de veinte especies nuevas. "Hemos observado una dinámica importante: gracias a los avances tecnológicos en bacteriología, se publica mucho más sobre las especies de bacterias recién descubiertas", explica el Dr. Goldenberger. Esta evolución facilitará en el futuro el diagnóstico correcto de las infecciones causadas por patógenos poco comunes y su tratamiento eficaz desde el principio.
Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención
12.01.2024
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